Répertoire des professeures et professeurs

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Unités de recherche

Centre d'excellence en recherche sur les maladies orphelines - Fondation Courtois (CERMO-FC)
Institut des sciences de l'environnement de l'UQAM (ISE)

Affiliations externes principales

Séminaire interdisciplinaire de bio-informatique (2025, 2024, 2023, 2020)
Initiation à la recherche en informatique (2025, 2024)
Projet technique (2024, 2023)
Rapport technique (2024, 2023)
Méthodes d'intelligence artificielle en bioinformat. (2024, 2022, 2021)
Projet de thèse (2024, 2023, 2021, 2020)
Stage industriel (2023)
Bioinformatique des structures (2023)
Bioinformatique (2022)
Atelier (2021, 2020)
Génomique et protéomique (2020)

Remita, Amine. (2024). Approches variationnelles pour l'analyse des séquences génomiques évolutives. (Thèse de doctorat). Université du Québec à Montréal.
Marcia Soares Almeida, Hayda. (2022). Learning to discover biosynthetic gene clusters in fungi. (Thèse de doctorat). Université du Québec à Montréal.
Halioui, Ahmed. (2018). Extraction de flux de travaux abstraits à partir des textes : application à la bioinformatique. (Thèse de doctorat). Université du Québec à Montréal.

Chatou, Mohammed Reda. (2024). Approche d'identification du nombre optimal de clusters dans les algorithmes de regroupement en combinant K-means et des métaheuristiques. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
De Montigny, Nicolas. (2024). Conception d'une méthode d'apprentissage machine pour la détection des microorganismes bactériens à partir de données de séquençages métagénomiques sans procédure d'alignement. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Balde, Abdourahmane. (2024). Méthode d'extraction de signatures de biomarqueurs métaboliques dans le cadre de prédiction des maladies chez les bovins laitiers. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Lebatteux, Dylan. (2019). Méthodes efficaces pour l'extraction d'attributs et la classification de séquences génomiques virales basées sur une approche indépendante de l'alignement. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Belarbi, Faten. (2019). Optimisation des hyperparamètres pour la classification des virus. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Mbaye, Mouhamadou Moustapha. (2019). Algorithme pour la reconstruction de séquences ancestrales en incluant les événements de transferts horizontaux de gènes. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Diop, Ndiaye. (2019). Évaluation des méthodes d'analyses d'expression différentielle des petits ARNs. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Goimard, Jérémy. (2018). Méthodes bio-informatiques basées sur les flux de travaux pour le séquençage à haut débit. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Wu, Chao Jung. (2018). Une approche distribuée de prédiction et d'analyses de microARNs : cas d'application du blé. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Remita, Mohamed Amine. (2017). Méthodes et plateformes bioinformatiques basées sur l'apprentissage automatique pour la classification efficace de séquences biologiques. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Aouabed, Zahia. (2016). Méthodes bio-informatiques pour l'analyse des mécanismes moléculaires conduisant à la résistance aux médicaments dans le cancer du sein. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Kiani, Golrokh. (2015). Bioinformatics approach for the identification of fragile regions on the human genome. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Daigle, Bruno. (2013). Méthodes bioinformatiques pour l'évaluation de la classification du virus du papillome humain. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Leclercq, Mickaël. (2012). Identification et caractérisation de microARNs dans les ESTs du blé par des méthodes bioinformatiques. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.

Diallo, A.B., Lord, E., Leclercq, M., Boc, A. et Makarenkov, V. (2012). Armadillo, an elegant workflow platform for bioinformatics education and task automation. PLOS One, 7(1).
Obtenir "Armadillo, an elegant workflow platform for bioinformatics education and task automation" aux bibliothèques de l'UQAM
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Obtenir "Comparative analysis of the primate X inactivation Center Region and Reconstruction of the Ancestral Primate XIST Locus" aux bibliothèques de l'UQAM
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Badescu, D., Boc, A., Diallo, A.B. et Makarenkov, V. (2011). Predicting site-specific human selective pressure using evolutionary signatures. Bioinformatics, 27(10-13), i266–i274.
Obtenir "Predicting site-specific human selective pressure using evolutionary signatures" aux bibliothèques de l'UQAM
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Obtenir "A whole genome study and identification of specific carcinogenic regions of the Human Papilloma Viruses" aux bibliothèques de l'UQAM
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Diallo, A.B., Badescu, D., Makarenkov, V. et Blanchette, M. (2009). Comparison of four discrimination functions for detecting genomic regions responsible for disease and their application to the Neisseria meningitidis data. Dans International Federation of Classification Societies 2009, Dresden, Germany. Springer-verlag.
Diallo, A.B., Badescu, D., Makarenkov, V. et Blanchette, M. (2008). Phylogeny of the Human Papilloma Viruses and Carcinome classi¿cation. Dans Proceeding of the ¿rst joint meeting of the Classi¿cation and Data analysis Group and the French Classi¿cation Society, Caserta, Italy.
Nguyen, D., Boc, A., Diallo, A.B. et Makarenkov, V. (2007). Étude de la classification des bactériophages. Dans Proc. of the 13th meeting of the Société Francophone de Classification.
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Diallo, A.B., Diallo, A.B. et Makarenkov, V. (2005). Une nouvelle méthode efficace pour l'estimation des données manquantes en vue de l'inférence phylogénétique. Dans Proceeding of the 12th meeting of Société Francophone de Classification, Montréal, Canada.
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Diallo, A.B., Makarenkov, V., Boc, A. et Lapointe, F.J. (2004). Une nouvelle méthode efficace pour l'estimation des données manquantes dans les séquences des nucléotides avant la reconstruction phylogénétique. Dans Proceedings of the 5th meetings of Journées Ouvertes de Bioinformatique et Mathématiques.
Diallo, A.B., Makarenkov, V. et Boc, A. (2004). Une nouvelle méthode pour la détection de transferts horizontaux de gène : la réconciliation topologique d'arbres de gène et d'espèces. Dans Proceedings of the 5th meetings of Journées Ouvertes de Bioinformatique et Mathématiques.
Diallo, A.B., Boc, A. et Makarenkov, V. (2003). Comment détecter le transfert latéral de gènes dans la classification des espèces. Dans Proceeding of the 12th meeting of la Société Francophone de Classification.

Abdoulaye Banire Diallo

Abdoulaye Banire Diallo

Abdoulaye Banire Diallo

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