Isabelle Marcotte
Professeure

Isabelle Marcotte
Professeure
Unité : Département de chimie
Courriel : marcotte.isabelle@uqam.ca
Téléphone : (514) 987-3000 poste 5015
Local : CB-3140
Langues :
Français, Anglais
Liens d'intérêt
Informations générales
Cheminement académique
Études postdoctorales - ETH de Zürich (2003-2006)
Doctorat en chimie - Université Laval (1998-2003)
Maîtrise en chimie - Université de Montréal (1994-1997)
Baccalauréat en chimie - Université du Québec à Rimouski (1991-1994)
Unités de recherche
- Centre de recherche sur les nanomatériaux et l'énergie (NanoQAM)
Partenaires (organismes, entreprises)
- Les Laboratoires Iso-BioKem Inc., Ministère des Pêches et Océans Canada,Corealis Pharma Inc.
Affiliations externes principales
Enseignement
- Methodes d'analyses spectroscopiques avancees (2016, 2018)
- Methodes experimentales en biochimie (2016, 2017, 2018)
- Seminaire de recherche (2016)
- Proposition de recherche (2016)
- Etude spectroscopique des systemes biologiques (2017)
- Methodes intrumentales (2018)
Communications
- Participation au balado "20%" sur les femmes en sciences et en technologie (2019)
- Participation à la capsule "Valoriser les ressources aquatiques" du FRQNT (2015)
- Participation à l'émission le Code Chastenay, Épisode 99: La moule: nouveau biomatériau de pointe? (2013)
- Participation à l'émission "Science ou Fiction" (épisode sur la soie d'araignée) TV5 (2010)
- Participation à l'émission "La Quête", Épisode 37, TFO (2008)
- Interviewée pour l'article "Le mystère de la soie d'araignée" par D. Forget, Actualités UQAM (2007)
Distinctions
- 2014 - Prix Relève en Recherche de la Faculté des Sciences de l'UQAM
- 2012 - Travaux sur le byssus de la moule parmi les 50 défis à relever d'ici 2050 d'après Québec Science (Octobre 2012)
Directions de thèses et mémoires
Thèses de doctorat
- Gravel, Andrée (2016)Étude biophysique de la fonction et du rôle de segments intra- et extracellulaires du canal hERG dans le syndrome du QT long, et développement de nouvelles membranes modèles. (Thèse de doctorat). Université du Québec à Montréal.
- Beaugrand, Maïwenn (2015)Structure and function studies on the hERG potassium channel including the development and characterization of membrane mimetics. (Thèse de doctorat). Université du Québec à Montréal.
Mémoires
- Mahabadi, Mahsa (2020)Effect of the Deuteration Conditions on the Lipid Profile of Escherichia Coli and Bacillus Subtilis (Effets des conditions de croissance sur le profil lipidique de bactéries). (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Bourgouin, Jean-Philippe (2020)Stratégie de marquage isotopique de la membrane lipidique des bactéries et des microalgues pour la résonance magnétique nucléaire du deutérium de l'état solide in cellulo. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Laadhari, Marwa (2017)Étude de l'interaction de peptides antimicrobiens avec des bactéries intactes par résonance magnétique nucléaire. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Dos Anjos Gomes da Silva, André Luiz (2017)Étude de la toxicité des nanoparticules d'argent et d'oxyde de titane pour Chlamydomonas reinhardtii. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Chokouadeu Youmssi, David Vernon (2016)Étude du rôle des ions métalliques dans la formation et les propriétés mécaniques des fibres de byssus pour le développement de matériaux biomimétiques. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Séguin Heine, Marc-Olivier (2013)Étude de la teneur en métaux, des propriétés mécaniques, de la structure et de la dynamique moléculaire des fibres de byssus de la moule en relation avec son environnement. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Tardy-Laporte, Catherine (2012)Étude de l'interaction d'agents antimicrobiens et de pigments algaux extraits de diatomées avec les membranes cellulaires d'Escherichia coli par résonance magnétique nucléaire. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Brisebois, Patrick (2012)Étude spectroscopique de l'interaction du fullerénol avec des membranes cellulaires modèles et synthèse de nanoparticules à base de fullerène. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Chartrand, Étienne (2010)Expression et purification de l'hélice transmembranaire S5 du canal potassique hERG et étude par RMN du rôle du segment extracellulaire ILE583-TYR597 dans le syndrome du long QT. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
- Larocque, Germain (2009)Étude de l'effet de la formulation pharmaceutique sur l'interaction fluvastatine-membrane et développement de membranes artificielles modèles pour l'étude de la pénétration membranaire de médicaments. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec à Montréal.
Autres directions et supervisions
- Bouhlel, Zeineb (2019) Potentiel antimicrobien du pigment microalgal marin marennine sur Vibrio splendidus: Étude de son interaction membranaire par résonance magnétique nucléaire. (Thèse de doctorat en océanographie). Université du Québec à Rimouski.
- Nirasay, Souryvanh (2017) Élaboration de membranes phospholipidiques supportées sur des surfaces nanopatternées en vue d'améliorer le criblage des médicaments. (Thèse de doctorat en chimie). Université du Québec à Montréal. https://archipel.uqam.ca/10485/1/D3279.pdf
- Byette, Frédéric (2016) Développement de matériaux à base de protéines extraites du byssus de la moule bleue. (Thèse de doctorat en chimie). Université du Québec à Montréal.
- Bouhlel, Zeineb (2014) Propriétés mécaniques des fibres de byssus chez différentes espèces de bivalves en relation avec leur composition biochimique. (Mémoire de maitrise en océanographie). Université du Québec à Rimouski.
- Leclaire, Marie-Ève (2014) Validation et conditionnement d'un test PAMPA amélioré pour l'évaluation de la perméabilité membranaire de médicaments. (Mémoire de maîtrise en pharmacie). Université de Montréal.
- Zaraa, Sarra (2013) Optimisation et évaluation d'un nouveau test PAMPA amélioré. (Mémoire de maîtrise en pharmacie). Université de Montréal.
- Hennebicq, Rémy (2012) Effet de la ponte sur la composition moléculaire et les propriétés mécaniques des filaments de byssus de la moule bleue (Mytilus edulis) en culture en suspension. (Mémoire de maîtrise en océanographie). Université du Québec à Rimouski.
- Byette, Frédéric (2010) Matériaux à base de protéines avec applications biomédicales. La fibroïne de soie comme support pour cultures cellulaires. (Mémoire de maitrise en chimie). Université du Québec à Montréal. https://archipel.uqam.ca/3669/1/M11578.pdf
Publications
Articles scientifiques
- Yan, X., Noël, F., Marcotte, I., DeWolf, C.E., Warschawski, D.E. et Boisselier, E. (2020). AHNAK C-Terminal Peptide Membrane Binding-Interactions Between the Residues 5654-5673 of AHNAK and Phospholipid Monolayers and Bilayers. Langmuir, 36, 362–369. http://dx.doi.org/10.1021/acs.langmuir.9b02973.
- Byette, F., Marcotte, I. et Pellerin, C. (2019). Covalently crosslinked mussel byssus protein-based materials with tunable properties. Peptide Science, 111(1), e24053. http://dx.doi.org/10.1002/pep2.24053.
- Sebastiao, M., Quittot, N., Marcotte, I. et Bourgault, S. (2019). Glycosaminoglycans Induce Amyloid Self-Assembly of a Peptide Hormone by Concerted Secondary and Quaternary Conformational Transitions. Biochemistry, 58(9), 1214–1225. http://dx.doi.org/10.1021/acs.biochem.8b01206.
- Bouhlel, Z., Arnold, A.A., Warschawski, D.E., Lemarchand, K., Tremblay, R. et Marcotte, I. (2019). Labelling strategy and membrane characterization of marine bacteria Vibrio splendidus by in vivo 2H NMR. Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes, 1861(4), 871–878. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2019.01.018.
- Warschawski, D.E., Arnold, A.A. et Marcotte, I. (2018). A New Method of Assessing Lipid Mixtures by 31P Magic-Angle Spinning NMR. Biophysical Journal, 114(6), 1368–1376. http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2018.01.025.
- Poulhazan, A., Arnold, A., Warschawski, D. et Marcotte, I. (2018). Unambiguous Ex Situ and in Cell 2D 13C Solid-State NMR Characterization of Starch and Its Constituents. International Journal of Molecular Sciences, 19(12), 3817. http://dx.doi.org/10.3390/ijms19123817.
- Arnold, A.A., Bourgouin, J.-P., Genard, B., Warschawski, D.E., Tremblay, R. et Marcotte, I. (2018). Whole cell solid-state NMR study of Chlamydomonas reinhardtii microalgae. Journal of Biomolecular NMR, 70, 123–131. http://dx.doi.org/10.1007/s10858-018-0164-7.
- Beaugrand, M., Arnold, A.A., Bourgault, S., Williamson, P.T.F. et Marcotte, I. (2017). Comparative study of the structure and interaction of the pore helices of the hERG and Kv1.5 potassium channels in model membranes. European Biophysics Journal, 46(6), 549–559. http://dx.doi.org/10.1007/s00249-017-1201-2.
- Bouhlel, Z., Genard, B., Ibrahim, N., Carrington, E., Babarro, J.M.F., Lok, A.,...Marcotte, I. (2017). Interspecies comparison of the mechanical properties and biochemical composition of byssal threads. The Journal of Experimental Biology, 220(6), 984–994. http://dx.doi.org/10.1242/jeb.141440.
- Booth, V., Warschawski, D.E., Santisteban, N.P., Laadhari, M. et Marcotte, I. (2017). Recent progress on the application of 2 H solid-state NMR to probe the interaction of antimicrobial peptides with intact bacteria. Biochimica et Biophysica Acta – Proteins and Proteomics, 1865(11), 1500–1511. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbapap.2017.07.018.
- Warnet, X.L., Laadhari, M., Arnold, A.A., Marcotte, I. et Warschawski, D.E. (2016). A 2H magic-angle spinning solid-state NMR characterisation of lipid membranes in intact bacteria. Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes, 1858(1), 146–152. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2015.10.020.
- Laadhari, M., Arnold, A.A., Gravel, A.E., Separovic, F. et Marcotte, I. (2016). Interaction of the antimicrobial peptides caerin 1.1 and aurein 1.2 with intact bacteria by 2 H solid-state NMR. Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes, 1858(12), 2959–2964. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2016.09.009.
- Beaugrand, M., Arnold, A.A., Juneau, A., Gambaro, A.B., Warschawski, D.E., Williamson, P.T.F. et Marcotte, I. (2016). Magnetically Oriented Bicelles with Monoalkylphosphocholines: Versatile Membrane Mimetics for Nuclear Magnetic Resonance Applications. Langmuir, 32(49), 13244–13251. http://dx.doi.org/10.1021/acs.langmuir.6b03099.
- Byette, F., Laventure, A., Marcotte, I. et Pellerin, C. (2016). Metal–Ligand Interactions and Salt Bridges as Sacrificial Bonds in Mussel Byssus-Derived Materials. Biomacromolecules, 17(10), 3277–3286. http://dx.doi.org/10.1021/acs.biomac.6b01010.
- Ng, C.-A., Gravel, A.E., Perry, M.D., Arnold, A.A., Marcotte, I. et Vandenberg, J.I. (2016). Tyrosine Residues from the S4-S5 Linker of Kv11.1 Channels Are Critical for Slow Deactivation. Journal of Biological Chemistry, 291(33), 17293–17302. http://dx.doi.org/10.1074/jbc.M116.729392.
- Warnet, X.L., Arnold, A.A., Marcotte, I. et Warschawski, D.E. (2015). In cell solid-state NMR: an emerging technique for the study of biological membranes. Biophysical Journal, 109(12), 2461–2466. http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2015.10.041.
- Arnold, A.A., Genard, B., Warschawski, D.E., Zito, F., Tremblay, R. et Marcotte, I. (2014). Identification of lipid and saccharide constituents of whole microalgal cells by 13C solid-state NMR. Biochimica et biophysica acta – Biomembranes, 1858, 369–377. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2014.07.017.
- Seguin-Heine, M.-O., Lachance, A.-A., Genard, B., Myrand, B., Pellerin, C., Marcotte, I. et Tremblay, R. (2014). Impact of open-sea habitat on byssus attachment of suspension-cultured blue mussels (Mytilus edulis). Aquaculture, 426-427, 189–196. http://dx.doi.org/10.1016/j.aquaculture.2014.02.006.
- Beaugrand, M., Arnold, A.A., Hénin, J., Warschawski, D.E., Williamson, P.T.F. et Marcotte, I. (2014). Lipid concentration and molar ratio boundaries for the use of isotropic bicelles. Langmuir, 30(21), 6162–6170. http://dx.doi.org/10.1021/la5004353.
- Gastineau, R., Turcotte, F., Pouvreau, J.-B., Morançais, M., Fleurence, J., Windarto, E., Prasetiya, F.S., Arsad, S., Babin, M., Coiffard, L., Couteau, C., Bardeau, J.-F., Jacquette, B., Leignel, V., Hardivillier, Y., Marcotte, I.,... Mouget, J.-L. (2014). Marennine, Promising Blue Pigments from a Widespread Haslea Diatom Species Complex. Marine Drugs, 12(6), 3161–3189. http://dx.doi.org/10.3390/md12063161.
- Byette, F., Pellerin, C. et Marcotte, I. (2014). Self-assembled pH-responsive films prepared from mussel anchoring threads. Journal of Materials Chemistry B, 2(37), 6378–6386. http://dx.doi.org/10.1039/C4TB01021C.
- Tardy-Laporte, C., Arnold, A.A., Génard, B., Gastineau, R., Morançais, M., Mouget, J.L.,.... Marcotte, I. (2013). A 2H solid-state NMR study of effect of antimicrobials on intact Escherichia coli without mutating. Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes, 1828(2), 614–622. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2012.09.011.
- Gravel, A., Arnold, A.A., Dufourc, E.J. et Marcotte, I. (2013). An NMR investigation of the structure, function and role of the hERG channel selectivity filter in the long QT syndrome. Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes, 1828(6), 1494–1502. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2013.02.012.
- Friddin, M.S., Smithers, N.P., Beaugrand, M., Marcotte, I., Williamson, P.T.F., Morgan, H. et de Planque, M.R.R. (2013). Single-channel electrophysiology of cell-free expressed ion channels by direct incorporation in lipid bilayers. Analyst, 138(24), 7294–7298. http://dx.doi.org/10.1039/C3AN01540H.
- Arnold, A.A., Byette, F., Séguin-Heine, M.-O., LeBlanc, A., Sleno, L., Tremblay, R.,... Marcotte, I. (2013). Solid-state NMR structure determination of whole anchoring threads from the blue mussel Mytilus edulis. Biomacromolecules, 14(1), 132–141. http://dx.doi.org/10.1021/bm301493u.
- Arnold, A.A., Terskikh, V., Naccache, R., Marcotte, I. et Capobianco, J.A. (2013). Structure of NaYF4 upconverting nanoparticles: a multinuclear solid-state NMR and DFT computational study. The Journal of Physical Chemistry C, 117(48), 25733–25741. http://dx.doi.org/10.1021/jp405813a.
- Hennebicq, R., Fabra, G., Pellerin, C., Marcotte, I., Myrand, B. et Tremblay, R. (2013). The effect of spawning of cultured mussels (Mytilus edulis) on mechanical properties, chemical and biochemical composition of byssal threads. Aquaculture, 410-411, 11–17. http://dx.doi.org/10.1016/j.aquaculture.2013.06.011.
- Brisebois, P.P., Arnold, A.A., Chabre, Y.M., Roy, R. et Marcotte, I. (2012). Comparative study of the interaction of fullerenol nanoparticles with eukaryotic and bacterial model membranes using solid-state NMR and FTIR spectroscopy. European Biophysics Journal, 41(6), 535–544. http://dx.doi.org/10.1007/s00249-012-0809-5.
- Leblanc, A., Arnold, A.A., Nadalini, J.-B., Seguin-Heine, M.-O., Marcotte, I., Tremblay, R. et Sleno, L. (2012). Determination of isotopic labeling of proteins by precursor ion scanning liquid chromatography/tandem mass spectrometry of derivatized amino acids applied to nuclear magnetic resonance studies. Rapid Communications in Mass Spectrometry, 26(10), 1165–1174. http://dx.doi.org/10.1002/rcm.6204.
- Nirasay, S., Badia, A., Leclair, G., Claverie, J.P. et Marcotte, I. (2012). Polydopamine-supported lipid bilayers. Materials, 5(12), 2621–2636. http://dx.doi.org/10.3390/ma5122621.
- Lachance, A.-A., Hennebicq, R., Myrand, B., Sévigny J.-M., Kraffe, É., Marty, Y., Marcotte, I.,... Tremblay, R. (2011). Biochemical and genetic characteristics of suspension-cultured mussels (Mytilus edulis) in relation to byssal thread production and losses by fall-off. Aquatic Living Resource, 24(3), 283–293. http://dx.doi.org/10.1051/alr/2011115.
- Byette, F., Bouchard, F., Pellerin, C., Paquin, J., Marcotte, I. et Mateescu, M.A. (2011). Cell-culture compatible silk fibroin scaffolds concomitantly patterned by freezing conditions and salt concentration. Polymer Bulletin, 67(1), 159–175. http://dx.doi.org/10.1007/s00289-010-0438-z.
- Warschawski, D.E., Arnold, A.A., Beaugrand, M., Gravel, A., Chartrand, E. et Marcotte, I. (2011). Choosing membrane mimetics for NMR structural studies of transmembrane proteins. Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes, 1808(8), 1957–1974. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2011.03.016.
- Chabre, Y., Brisebois, P., Abbasi, L., Kerr, S.C., Fahy, J.V., Marcotte, I. et Roy, R. (2011). Hexaphenylbenzene as a Rigid Template for the Straightforward Syntheses of "Star-Shaped" Glycodendrimers. Journal of Organic Chemistry, 76(2), 724–727. http://dx.doi.org/10.1021/jo102215y.
- Nirasay, S., Mouget, Y., Marcotte, I. et Claverie J. P. (2011). Supported bilayer on a nanopatterned membrane as model PAMPA membranes. International Journal of Pharmaceutics, 421(1), 170–175. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijpharm.2011.09.013.
- Larocque, G., Arnold, A.A., Chartrand, É., Mouget, Y. et Marcotte, I. (2010). Effect of Sodium Bicarbonate as a Pharmaceutical Formulation Excipient on the Interaction of Fluvastatin with Membrane Phospholipids. European Biophysics Journal, 39(12), 1637–1647. http://dx.doi.org/10.1007/s00249-010-0622-y.
- Chartrand, É., Arnold, A.A., Gravel, A., Jenna, S. et Marcotte, I. (2010). Potential role of the membrane in the hERG channel functioning and drug-induced long QT syndrome. Biochimica et Biophysica Acta – Biomembranes, 1798(9), 1651–1662. http://dx.doi.org/10.1016/j.bbamem.2010.05.019.
- Arnold, A.A. et Marcotte, I. (2009). Studying natural structural protein fibers by solid-state nuclear magnetic resonance. Concepts in Magnetic Resonance: Part A, 34A(1), 24–47. http://dx.doi.org/10.1002/cmr.a.20132.
- Marcotte, I., Van Beek, J.D. et Meier, B.H. (2007). Molecular order and structure of spider dragline silk investigated by two-dimensional solid-state NMR spectroscopy. Macromolecules, 40(26), 1995–2001. http://dx.doi.org/10.1021/ma062452n.
- Marcotte, I., Belanger, A. et Auger, M. (2006). The orientation effect of gramicidin A on bicelles and Eu3+-doped bicelles as studied by solid-state NMR and FTIR spectroscopy. Chemistry and Physics of Lipids, 139(2), 137–149. http://dx.doi.org/10.1016/j.chemphyslip.2005.12.002.
- Marcotte, I. et Auger, M. (2005). Bicelles as model membranes for solid- and solution-state NMR studies of membrane peptides and proteins. Concepts in Magnetic Resonance: Part A, 24A(1), 17–37. http://dx.doi.org/10.1002/cmr.a.20025.
- Marcotte, I., Auger, M., Separovic, F. et Gagné, S.M. (2004). A Multidimensional 1H NMR Investigation of the Conformation of Methionine-Enkephalin in Fast-Tumbling Bicelles. Biophysical Journal, 86(3), 1587–1600. http://dx.doi.org/10.1016/S0006-3495(04)74226-5.
- Marcotte, I., Ouellet, M. et Auger, M. (2004). Insights on the Interaction of Met-Enkephalin with Negatively Charged Membranes: an Infrared and Solid-Sate NMR Spectroscopic Study. Chemistry and Physics of Lipids, 127(2), 175–187. http://dx.doi.org/10.1016/j.chemphyslip.2003.10.012.
- Marcotte, I., Wegener, K., Lam, Y.-H., Chia, B.S.C., de Planque, M.R.R., Bowie, J.H.,... Separovic, F. (2003). Interaction of Antimicrobial Peptides from Australian Amphibians with Lipid Membranes. Chemistry and Physics of Lipids, 122(1-2), 107–120. http://dx.doi.org/10.1016/S0009-3084(02)00182-2.
- Marcotte, I., Dufourc, E.J., Ouellet, M. et Auger, M. (2003). Interaction of the Neuropeptide Met-Enkephalin with Zwitterionic and Negatively Charged Bicelles as Viewed by 31P and 2H Solid-State NMR. Biophysical Journal, 85(1), 328–339. http://dx.doi.org/10.1016/S0006-3495(03)74477-4.
- Paul, G.J.C., Marcotte, I., Anastassopoulou, J., Arkas, M., Paleos, C.M. et Bertrand, M.J. (1996). An investigation of the clustering processes occurring in liquid-assisted secondary ion mass spectrometry for alkyl quaternary ammonium bromides. Journal of Mass Spectrometry, 31(1), 95–100. http://dx.doi.org/10.1002/(SICI)1096-9888(199601)31:1<95::AID-JMS275>3.0.CO;2-V.
Chapitres de livre
- Marcotte, I. et Booth, V. (2014). 2H solid-state NMR study of peptide-membrane interactions in intact bacteria. Dans F. Separovic et A. Naito (dir.). Advances in Biological Solid-State NMR: Proteins and Membrane-Active Peptides (p. 459–475). Cambridge : Royal Society of Chemistry.
Notes: collection New Developments in NMR - Lefèvre, T., Byette, F., Marcotte, I. et Auger, M. (2014). Protein- and peptide-based materials: a source of inspiration for innovation. Dans R. Gauvin et M. Leclerc (dir.). Functional materials for energy, sustainable development and biomedical sciences (p. 415–442). Berlin : De Gruyter.